全自動顯微鏡是一款編碼顯微鏡，也就是說，顯微鏡放大倍率和可變光圈位置將被實時傳送到軟件。刻度條隨同實時圖像一起顯示，并在放大倍率變化時同步更新。存儲圖像時，參數隨同圖像一起保存，以便將來需要時隨時調用，并通過軟件實現全景自動掃描、自動拼圖、自動回位、同步瀏覽、遠程遙控等全自動化功能，以達到提高工作效率目的的光電算一體化的高科技產品。
全自動顯微鏡計算機通過軟件自動控制顯微鏡動作的全自動系統，操作菜單和所采集的圖象及顯微鏡功能控制同界面，即由軟件控制自動調焦、自動物鏡切換、自動功能轉換（明場、暗場、偏光、微分干涉相襯等觀察方法）、自動掃描載物臺、自動調光、自動采集圖像等。實現多個特征位置記憶，操作者可精確地對前幾次或幾十次的位置快速定位可實現多視野的拼接和觀察，再根據實際需要靈活進行圖象處理分析等。
全自動顯微鏡的優勢是：
1、外觀漂亮，體積小巧，可以放在任意的桌子上，方便在各種場合使用；
2、顯微鏡實現全自動，配套相應的軟件可以實現*自動化；
3、可靠性強、穩定性好，辨別和確認缺陷的能力好；
4、物鏡選擇和觀察方法切換連動，自動地調節亮度光圈。提高了觀察速度并減輕疲勞；
6、光源自動開關及明亮度自動控制；
7、靜態圖像追溯:采集后的靜態圖像，瀏覽時可回溯到該圖像原始鏡下坐標、動態、原始圖像立現。
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